מטבע הדברים באופי העבודה של מתנדבי זק"א נתקלים הם בשאלות ובבעיות הלכתיות קשות, לפעמים בקבלת החלטות חורצות גורל, בשאלות של הצלת חיים ופיקוח נפש, זיהוי הלכתי, היתר עגונות, שבת וחגים, איסורים והיתרים. שאלת קשות וסבוכות נערמו במהלך העבודה והתחדשו ממקרה למקרה. אי לכך הוקם 'ועד רבני זק"א' להנחות את הארגון ומתנדביו, לתת הוראות הלכה למעשה בכל עניין ודבר שמתעורר בעבודת הקודש, לחזק ולהעמיק את לימוד ההלכה בקרב מתנדבי זק"א בנושאים הקשורים לעבודת זק"א.