החיפושים בוצעו לאורך מספר ימים בשיתוף פעולה מלא עם משטרת ישראל ויחידת להב"ה של כבאות והצלה, וכללו סריקות קרקעיות, סריקות אוויריות באמצעות יחידת הרחפנים של זק"א, פעילות יחידת הצוללים בתוואי הנחל ושימוש באמצעי סונאר מתקדמים, תוך ניהול הפעילות מחפ"ק ייעודי שהוקם במקום.
מצ"ב סינק מהזירה של חיים אוטמזגין, מפקד היחידות המיוחדות של זק"א, שפיקד על החיפושים במשך ארבעה ימים ברציפות.