'יחידת הצוללים' של זק"א מורכבת מעשרות צוללים בפריסה ארצית, בעלי הסמכה גבוהה בדרגות שונות, המצוידים בציוד צלילה לתגובה מיידית, בחיפוש אחר יורדי ים שנקלעו למצוקה. במהלך השנה מוקפצים המתנדבים לעשרות אירועי נעדרים.
הרעיון להקמת היחידה והיוזמה נבעו מהצורך החיוני אליו נחשפו מפקדי יחידת איתור נעדרים של זק"א. במהלך החיפושים אחר עו"ד משה קניאל שטבע בים בתל אביב בשנת 2005, מאות מתנדבים סרקו רגלית את החופים כאשר מעליהם חגו כלי טייס זעירים ומסוקים, אך למעמקי הים לא הצליחו המתנדבים להגיע בשל היעדר אנשי מקצוע מיומנים. בזק"א מהרו להסיק מסקנות ובמלאות 30 יום למציאת גופתו של עו"ד משה קניאל הוקמה על שמו ולזכרו 'יחידת הצוללים' של זק"א. על מתנדבי היחידה נמנים: בוגרי שייטת, רופאים, עורכי דין ואנשי כלכלה שציינו את הזכות שנפלה בחלקם להימנות על מתנדבי זק"א. בכך משלים ארגון זק"א עוד אבן בפסיפס העשייה למען הקהילה ובמערך כוחות ההצלה בישראל.